Командир з'єднання кораблів зобов'язаний:
планувати роботу і здійснювати заходи щодо підтримання та удосконалення бойової й мобілізаційної готовності та вимагати їх виконання, своєчасно вносити необхідні зміни до планів роботи, вживати заходів щодо збереження державної таємниці;
готувати з'єднання кораблів відповідно до поставлених завдань;
керувати діяльністю начальника штабу з'єднання кораблів, своїх заступників і помічників;
організовувати та безпосередньо керувати бойовою підготовкою, здійснювати контроль за її ходом, об'єктивно оцінювати досягнуті підлеглими результати, підбивати підсумки й заохочувати кращих, узагальнювати та впроваджувати передовий досвід у практику навчання особового складу з'єднання кораблів, ефективно використовувати навчально-матеріальну базу, спрямовувати кошти та матеріальні засоби на удосконалення цієї бази;
особисто навчати безпосередньо підпорядкованих йому командирів кораблів, проводити з ними заняття, семінари тощо;
систематично виходити в море на кораблях свого з'єднання, давати оцінку діям екіпажів кораблів як під час виконання бойових завдань, так і під час проведення навчань, відпрацювання завдань за курсом підготовки, виконання маневрів;
знати стан засобів боротьби за живучість кораблів з'єднання та рівень підготовки особового складу з боротьби за живучість;
своєчасно вживати заходів щодо виконання завдань соціально-психологічного забезпечення бойової підготовки, професійної діяльності та гуманітарної підготовки особового складу, організації виховної та культурно-просвітницької роботи;
знати тактико-технічні дані, бойові можливості і бойову готовність кораблів свого з'єднання, стан корпусів кораблів, озброєння й техніки, порядок експлуатації та ремонту;
знати стан справ у з'єднанні кораблів, ділові та морально-психологічні якості своїх заступників, командирів кораблів, знати озброєння та бойову техніку кораблів з'єднання, вміло керувати з'єднанням кораблів як у повсякденному житті, так і під час виконання бойових завдань;
постійно удосконалювати форми та методи управління кораблями з'єднання;
особисто готувати штаб з'єднання кораблів відповідно до завдань, поставлених з'єднанню кораблів;
контролювати виконання у з'єднанні кораблів заходів щодо правового виховання особового складу;
постійно виховувати підлеглих у дусі гуманізму та людяності, посилаючись на загальновизнані принципи міжнародного права;
проводити роботу щодо зміцнення військової дисципліни, запобігання надзвичайним подіям і злочинам серед особового складу, своєчасно виявляти й усувати їх причини; аналізувати стан військової дисципліни і доповідати про це старшому командирові (начальникові);
знати потреби й запити особового складу, приймати рішення за заявами, скаргами та іншими зверненнями особового складу;
підтримувати у з'єднанні кораблів такий внутрішній порядок, який гарантує неухильне виконання законів України, вимог військових статутів Збройних Сил України ( 548-14, 549-14, 550-14, 551-14 ) та цього Положення;
бути прикладом дисциплінованості, неухильного виконання вимог чинного законодавства України, наказів старших командирів (начальників);
бути ввічливим і справедливим у ставленні до підлеглих, не принижувати їх честі та гідності;
організовувати своєчасну видачу кораблям з'єднання всіх видів забезпечення та перевіряти його повноту;
особисто керувати кадровою роботою;
керувати підбором кандидатів для проходження військової служби за контрактом (у з'єднаннях кораблів 3-го і 4-го рангів);
уживати заходів щодо створення атмосфери відвертості між військовослужбовцями з'єднання кораблів, нетерпимості до недоліків, байдужості та пасивності;
проводити приймання особового складу з'єднання кораблів з особистих питань (не менше ніж двічі на місяць, для прибулих з інших населених пунктів - у зручний для них час); на прохання батьків матросів та старшин знайомити їх з побутовими умовами життя особового складу;
під час стоянки в пункті базування організовувати охорону кораблів з'єднання та контролювати несення чергової та вахтової служб, не менше одного разу на місяць перевіряти проведення розводу добового наряду, несення ним служби, а також стан постів, додержання порядку видавання (здавання) зброї особам чергової та вахтової служб;
перед початком кожного періоду навчання видавати наказ з питань організації бойової підготовки, чергової та вахтової служб;
щоденно видавати накази по стройовій частині, а в разі потреби і з питань бойової підготовки та матеріально-технічного забезпечення кораблів;
керувати фінансово-господарською діяльністю з'єднання кораблів, забезпечувати необхідне та ощадливе використання матеріальних засобів і витрачання коштів;
проводити планові і раптові перевірки з'єднання кораблів, організовувати щорічне проведення на кораблях з'єднання інвентаризації матеріальних засобів;
проводити один раз на рік огляд кожного корабля з'єднання, а також проводити огляд корабля у разі включення (виключення) його до складу (зі складу) з'єднання кораблів;
призначати корабель для свого перебування й розміщення штабу з'єднання кораблів;
щоденно після підіймання прапора Військово-Морських Сил Збройних Сил України приймати від начальника штабу з'єднання кораблів доповідь про стан кораблів з'єднання та наявність запасів на них;
під час стоянки кораблів з'єднання в пункті базування організувати щодобовий контроль за якістю приготування й повнотою видачі їжі для особового складу, не менше одного разу на тиждень особисто перевіряти якість приготування їжі у їдальні берегової бази чи на одному з кораблів з'єднання. У разі неможливості особисто провести ці заходи доручати їх проведення своєму заступникові;
піклуватися про здоров'я підлеглих, вживати всіх необхідних заходів для їхнього фізичного зміцнення;
організовувати та здійснювати заходи, спрямовані на захист особового складу, озброєння, бойової та іншої техніки, матеріальних засобів кораблів з'єднання від зброї масового ураження і звичайних засобів ураження;
уживати заходів щодо запобігання та ліквідації наслідків забруднення довкілля.