Склад Комісії формується за поданням громадської організації «Родина Героїв «Небесної Сотні», родин Героїв Небесної Сотні (близькі родичі або уповноважені ними особи), чиїми іменами названі номінації стипендій, рад молодих вчених при органах виконавчої влади, ради молодих вчених Національної академії наук України, рад молодих вчених національних галузевих академій наук, закладів вищої освіти, а також із представників МОН.