Рішення Комісії приймаються на її засіданнях у присутності не менше ніж двох третин її складу відкритим голосуванням простою більшістю голосів.
У разі рівної кількості голосів голос головуючого на засіданні є ухвальним.
Рішення Комісії оформляється протоколом, який підписується всіма членами, присутніми на засіданні.
На підставі рішення Комісії секретар Комісії готує відповідний проект наказу Мінагрополітики України, забезпечує його погодження та подання на підпис Міністру аграрної політики та продовольства України.