Секретар Комісії:
1) здійснює організаційне забезпечення засідань Комісії;
2) готує матеріали, що подаються до Комісії для розгляду на її засіданнях;
3) інформує членів Комісії про дату, місце та час проведення засідання;
4) забезпечує ведення й оформлення протоколів засідань;
5) доводить рішення Комісії до відома центральних органів виконавчої влади, до сфери управління яких належать заклади вищої освіти;
6) забезпечує ведення та зберігання документації, пов’язаної з роботою Комісії;
7) передає інформацію про результати засідань Комісії для розміщення на офіційному веб-сайті МОН.