Метою діяльності Комісії є забезпечення:
1) ефективного використання інтелектуального потенціалу, комерціалізація науково-технічних розробок вищих навчальних закладів та наукових установ;
2) створення ефективних організаційних і правових умов для реалізації державної політики в галузі військово-промислового комплексу, визначення пріоритетів його функціонування;
3) підготовки пропозицій для МОН, Міноборони та ДК «Укроборонпром» щодо розроблення та впровадження технологій для потреб оборони, безпеки та економіки країни.