Діяльність Комісії ґрунтується на засадах верховенства права, законності, незалежності, колегіальності, професіоналізму, об’єктивності та неупередженості, відповідальності, забезпечення прав людини та гендерної рівності, обґрунтованості прийнятих висновків.