Проведення другого етапу розслідування АП здійснюється у такому порядку:
визначення послідовності подій і обставин АП, а також (у разі наявності) виявлення суперечностей у доказах та встановлення небезпечних дій (рішень), умов, помилок, чинників персоналу (екіпажу) судна, які призвели до АП;
опис АП в хронологічній послідовності.