Відділи очолюють начальники відділів. Начальники відділу взаємодії з правоохоронними органами та інформаційно-аналітичної роботи, першого, другого і третього відділів процесуального керівництва та підтримання публічного обвинувачення та відділу документального забезпечення мають по одному заступнику, а начальник відділу запобігання правопорушенням в органах прокуратури - три заступники.