Начальник ГДА Держприкордонслужби:
1) затверджує положення про структурні підрозділи ГДА Держприкордонслужби;
2) затверджує посадові інструкції керівників структурних підрозділів, військовослужбовців та працівників ГДА Держприкордонслужби, визначає їхні обов’язки;
3) подає на затвердження в установленому порядку структуру та штатний розпис ГДА Держприкордонслужби;
4) приймає на роботу (військову службу) та звільняє з роботи (військової служби) військовослужбовців та працівників ГДА Держприкордонслужби в установленому законодавством порядку;
5) подає на затвердження в установленому законодавством порядку планово-звітну документацію про діяльність ГДА Держприкордонслужби;
6) організовує розроблення документів ГДА Держприкордонслужби щодо функціонування в умовах особливого періоду та затвердження їх наказами Адміністрації Державної прикордонної служби України;
7) приймає рішення щодо заохочення та притягнення до дисциплінарної відповідальності військовослужбовців та працівників ГДА Держприкордонслужби, вирішує питання підготовки та підвищення кваліфікації особового складу;
8) створює належні умови для праці, забезпечує дотримання законодавства про працю, соціальне страхування, правил, норм охорони праці, техніки безпеки та правил пожежної безпеки; укладає колективний договір із представниками трудового колективу або профспілки;
9) забезпечує роботу з дотримання вимог законодавства з питань охорони державної таємниці, службової інформації та захисту персональних даних;
10) у межах компетенції забезпечує виконання нормативно-правових актів з питань дотримання рівних прав та можливостей жінок і чоловіків, запобігання та протидії дискримінації за ознакою статі та сексуальним домаганням;
11) забезпечує в межах компетенції здійснення заходів щодо запобігання і протидії корупції;
12) здійснює розгляд запитів та звернень юридичних та фізичних осіб, проводить особистий прийом громадян;
13) надає дозвіл на роботу з документами, що зберігаються в ГДА Держприкордонслужби, юридичним та фізичним особам, а також вирішує питання видачі документів юридичним особам у тимчасове користування за межами ГДА Держприкордонслужби в установленому законодавством порядку;
14) представляє ГДА Держприкордонслужби у відносинах з іншими органами, підприємствами, установами та організаціями в Україні та за її межами;
15) здійснює інші передбачені законодавством повноваження.