ГДА Держприкордонслужби має право:
1) надавати в межах своєї компетенції органам Держприкордонслужби методичну допомогу щодо забезпечення збереженості документів НАФ, що зберігаються в них;
2) брати участь у розробленні проєктів розпорядчих актів Адміністрації Державної прикордонної служби України з питань архівної справи та погодженні проєктів інших розпорядчих актів органів Держприкордонслужби з питань, що належать до компетенції ГДА Держприкордонслужби;
3) здійснювати контроль за дотриманням в органах Держприкордонслужби норм законодавства щодо науково-технічного опрацювання, обліку та зберігання архівних документів (у тому числі з грифами секретності), здійснення діловодства та роботи їхніх експертних комісій;
4) розробляти (за погодженням з Державною архівною службою України) методичні рекомендації з архівної справи та діловодства, ініціювати скликання нарад, проведення семінарів з питань, що належать до компетенції ГДА Держприкордонслужби;
5) брати участь у засіданнях колегій, рад та нарадах Державної архівної служби України, а також органів Держприкордонслужби з дотичних або профільних питань ГДА Держприкордонслужби;
6) одержувати в установленому порядку (у межах своєї компетенції) від посадових осіб органів Держприкордонслужби відомості щодо зберігання архівних документів (у тому числі з грифами секретності), науково-технічного опрацювання документів та залучати в установленому порядку їхніх фахівців для проведення експертизи цінності документів;
7) отримувати в установленому порядку архівні документи органів Держприкордонслужби з метою виявлення таких, що підлягають внесенню до НАФ;
8) представляти в установленому порядку інтереси Державної прикордонної служби України в державних органах, органах місцевого самоврядування, міжнародних організаціях за напрямом діяльності ГДА Держприкордонслужби;
9) надавати користувачам архівні документи і довідковий апарат до них;
10) повертати фондоутворювачам на доопрацювання сформовані та оформлені справи, підготовлені описи справ, що не відповідають установленим законодавством вимогам; справи в неналежному санітарно-гігієнічному стані; справи, гриф секретності яких не приведено у відповідність до вимог законодавства;
11) обмежувати доступ до документів у зв’язку з їх науково-технічним опрацюванням, перевіркою наявності та стану або реставрацією та в інших передбачених законодавством випадках;
12) обмежувати в установленому законодавством порядку доступ до відомостей, що містяться в документах НАФ, які зберігаються в ГДА Держприкордонслужби;
13) відмовляти в доступі до документів особам у випадках, визначених законодавством;
14) ініціювати в установленому порядку питання притягнення до відповідальності посадових осіб і громадян, винних у порушенні законодавства про Національний архівний фонд та архівні установи;
15) вносити в установленому порядку Голові Держприкордонслужби пропозиції щодо скасування повністю чи в окремій частині актів джерел формування ГДА Держприкордонслужби, що суперечать законодавству з питань архівної справи;
16) з метою охорони службової інформації та державної таємниці, захисту прав власності та персональних даних, що містяться в документах, встановлювати відповідно до законодавства умови для їх використання;
17) в установленому законодавством порядку надавати архівні документи для тимчасового користування за межами ГДА Держприкордонслужби;
18) проводити наради, семінари з питань, що належать до компетенції ГДА Держприкордонслужби.