До складу сил і засобів функціональної підсистеми входять:
Центральна державна лабораторія ветеринарної медицини;
зональні спеціалізовані лабораторії ветеринарної медицини з хвороб тварин;
міжобласні спеціалізовані державні лабораторії ветеринарної медицини з хвороб птиці;
корпорація "Укрзооветпромпостач";
державні підприємства "Укрветпромпостач";
асоціація "Украгробіовет";
Державний науково-дослідний контрольний інститут ветеринарних препаратів і кормових добавок (м. Львів);
Державний науково-контрольний інститут біотехнології і штамів мікроорганізмів (м. Київ);
регіональні служби державного ветеринарного контролю на державному кордоні та транспорті;
обласні госпрозрахункові ветеринарно-санітарні загони;
лікарні, дільниці, пункти ветеринарної медицини;
лабораторії ветеринарної медицини;
державні лабораторії ветеринарно-санітарної експертизи на ринках;
міжобласні та прикордонні контрольно-токсикологічні лабораторії;
обласні біолабораторії;
обласні лабораторії прогнозів та діагностики шкідників і хвороб сільськогосподарських рослин;
бригади та ланки з боротьби з шкідниками і хворобами рослин об'єднань, акціонерних товариств;
Центральна науково-дослідна карантинна лабораторія;
центральний фумігаційний загін;
державні інспекції з карантину рослин Автономної Республіки Крим, областей, міст Києва і Севастополя та прикордонні пункти;
міжрайонні та районні пункти з карантину рослин;
лабораторії з карантину рослин;
фумігаційні загони та бригади.