Завданнями функціональної підсистеми зони відчуження є:
1) здійснення заходів цивільного захисту на об’єктах функціональної підсистеми зони відчуження;
2) забезпечення готовності підпорядкованих сил і засобів до дій, спрямованих на запобігання виникненню та реагування на надзвичайні ситуації на об’єктах функціональної підсистеми зони відчуження, здійснення заходів щодо запобігання виникненню надзвичайних ситуацій або небезпечних подій на об’єктах функціональної підсистеми зони відчуження;
3) організація та проведення моніторингу і прогнозування виникнення надзвичайних ситуацій та їх розвитку, визначення ризиків виникнення надзвичайних ситуацій на об’єктах функціональної підсистеми зони відчуження;
4) своєчасне і достовірне інформування заінтересованих органів виконавчої влади, населення та працівників про загрозу виникнення або виникнення надзвичайних ситуацій на об’єктах функціональної підсистеми зони відчуження;
5) проведення рятувальних та інших невідкладних робіт з ліквідації наслідків надзвичайних ситуацій на об’єктах функціональної підсистеми зони відчуження;
6) забезпечення планування заходів цивільного захисту;
7) організація та проведення навчань (тренувань) з підготовки органів управління функціональної підсистеми зони відчуження та підпорядкованих їм сил цивільного захисту;
8) розроблення та здійснення заходів, спрямованих на забезпечення сталого функціонування об’єктів функціональної підсистеми зони відчуження в особливий період;
9) навчання населення та працівників щодо поведінки та дій у разі виникнення надзвичайної ситуації на об’єктах функціональної підсистеми зони відчуження;
10) здійснення заходів щодо укриття працівників об’єктів функціональної підсистеми зони відчуження у захисних спорудах цивільного захисту;
11) розроблення та забезпечення виконання галузевих програм та планів з питань цивільного захисту;
12) створення, раціональне збереження і використання резерву матеріальних ресурсів, необхідних для запобігання і реагування на надзвичайні ситуації;
13) забезпечення підготовки керівного складу об’єктів функціональної підсистеми зони відчуження до дій у разі мобілізації та виконання завдань цивільного захисту у воєнний час з урахуванням норм міжнародного гуманітарного права у відповідних закладах освіти Державної служби України з надзвичайних ситуацій;
14) координація робіт із збирання, переробки, перевезення, зберігання та захоронення радіоактивних відходів промисловості, що утворюються під час проведення робіт з ліквідації наслідків Чорнобильської катастрофи, будівництва, експлуатації, реконструкції, зняття з експлуатації об’єктів, призначених для поводження з радіоактивними відходами, та закриття сховищ для їх захоронення;
15) забезпечення проведення робіт з визначення радіаційного стану зони відчуження, включно з промисловим майданчиком Чорнобильської атомної електростанції, дотримання норм радіаційної безпеки, проведення радіоекологічного моніторингу та радіаційного контролю на таких територіях та об’єктах, розташованих у їхніх межах;
16) інші завдання, визначені законодавством України.