Режими функціонування функціональної підсистеми зони відчуження встановлюються відповідно до статей 11–15 Кодексу, заходи з їх реалізації визначаються відповідно до Положення про ЄДСЦЗ.
Режим підвищеної готовності та режим надзвичайної ситуації для функціональної підсистеми зони відчуження встановлюється:
за рішенням Кабінету Міністрів України — для єдиної державної системи цивільного захисту в повному обсязі або частково для кількох окремих її функціональних підсистем;
за рішенням Державного агентства України з управління зоною відчуження — для функціональної підсистеми зони відчуження.