До сил цивільного захисту функціональної підсистеми належать:
спеціалізовані професійні аварійно-рятувальні служби (у разі їх утворення);
об’єктові аварійно-рятувальні служби (у разі їх утворення);
об’єктові формування цивільного захисту водогосподарських організацій;
об’єктові спеціалізовані служби цивільного захисту водогосподарських організацій;
добровільні формування цивільного захисту (у разі їх утворення).
Держводагентство на підставі пропозицій водогосподарських організацій складає (уточнює) розрахунок сил цивільного захисту функціональної підсистеми та щороку до 10 січня подає його до Мінприроди та Державної служби України з надзвичайних ситуацій.
Сили цивільного захисту функціональної підсистеми, крім добровільних формувань цивільного захисту, укомплектовуються персоналом (кадрами) та забезпечуються засобами цивільного захисту з урахуванням необхідності проведення робіт в автономному режимі протягом не менше трьох діб.