АІПС «Автоексперт» використовує такі функціональні підсистеми ЄІС МВС із спеціальними функціями центральної підсистеми ЄІС МВС (далі — ФП СФ):
ФП СФ «Інтеграційна взаємодія»;
ФП СФ «Інформаційна безпека»;
ФП СФ «Аналіз та звітність»;
ФП СФ «Єдине розподілене сховище»;
ФП СФ «Ведення довідників та класифікаторів»;
інші ФП СФ, необхідні для функціонування АІПС «Автоексперт».