Збереження цілісності інформації під час обробки та обміну в Електронному реєстрі забезпечується шляхом захисту від несанкціонованого доступу, що може призвести до її випадкової або умисної модифікації, спотворення чи знищення.
Інформація, що внесена та зберігається в Електронному реєстрі і зазнала будь-яких змін, зберігається в новій версії автоматично. Зберігається також інформація про всі внесені зміни.