Комісія відповідно до покладених на неї завдань:
здійснює розробку організаційних і методологічних принципів ведення Державного реєстру;
забезпечує внесення відомостей про випуск цінних паперів до Державного реєстру та підтримує їх в контрольному стані;
здійснює розробку технології та програмно-технічних засобів ведення Державного реєстру;
здійснює ведення Державного реєстру;
виконує функції адміністратора бази даних (збір, накопичення, обробка даних, що надходять зі структурних підрозділів центрального апарату та територіальних органів Комісії, актуалізація даних, їх зберігання, контроль права доступу тощо);
здійснює розробку інструктивних, технічних документів щодо формування, ведення та користування даними Державного реєстру;
здійснює інші функції, передбачені законодавством.