Функціональні можливості системи повинні забезпечувати:
1) можливість реєстрації користувачів, зокрема з використанням засобів електронної ідентифікації;
2) розмежування прав користувачів на внесення інформації та документів до системи, їх зміну, перегляд, виключення із системи;
3) можливість внесення інформації щодо волевиявлення особи та/або її батьків чи інших законних представників про надання згоди на вилучення клітин або відмову від раніше наданої згоди;
4) пошук і формування пар донор-реципієнт, можливість обміну інформацією та документами, у тому числі медичною інформацією, з іншими інформаційно-комунікаційними системами з метою визначення пар донор-реципієнт;
5) збирання, накопичення, обробку та передачу інформації про потенційних донорів та реципієнтів, а також згоду на вилучення клітин;
6) доступ до реєстру потенційних донорів відповідно до прав доступу користувачів;
7) захист інформації та документів, що містяться у системі, від несанкціонованого доступу, обробки, поширення, знищення, модифікації;
8) облік операцій (внесення інформації та документів до системи, їх зміна, виключення із системи), а також будь-яких дій, які вчиняються щодо зазначених інформації та документів;
9) збереження, автоматичне резервування і відновлення даних, що передавалися до системи, забезпечення безперебійного доступу до системи відповідно до прав доступу користувачів;
10) фіксацію кожного окремого випадку доступу до системи;
11) сумісність та електронну інформаційну взаємодію між системою та іншими інформаційно-комунікаційними системами в установленому законодавством порядку;
12) здійснення інших функцій, визначених законодавством.