До складу Апеляційної комісії входять заступники Голови Національного банку - куратори служб банківського нагляду та валютного контролю, виконавчий директор Дирекції з банківського регулювання та нагляду, директор Юридичного департаменту, керівники структурних підрозділів, що методологічно забезпечують виконання функцій банківського регулювання та нагляду, валютного регулювання і валютного контролю.
У разі потреби для висловлення своєї позиції на засідання можуть бути запрошені керівники структурних підрозділів, які виконують функції контролю за дотриманням банками вимог банківського регулювання та нагляду, валютного регулювання і валютного контролю та законодавства України з питань запобігання і протидії легалізації (відмиванню) доходів, одержаних злочинним шляхом.