Управління функціональною підсистемою здійснюють:
1) на державному рівні — Міністерство енергетики України, відділ промислової безпеки, протиаварійного, протипожежного та цивільного захисту Управління охорони праці, промислової безпеки, цивільного захисту та соціальної політики;
2) на об’єктовому рівні — керівники об’єктів функціональної підсистеми, їх структурні підрозділи (посадові особи) з питань цивільного захисту.