Наукові відділи ПЗУ мають право виконувати або брати участь у виконанні НДР на замовлення органів виконавчої влади, установ НАН України, наукових кураторів, інших установ і організацій на договірній основі, разом з якими можуть створювати спільні навчально-науково-виробничі комплекси. На наукові відділи покладаються функції координації досліджень на ПЗТ категорій регіональних ландшафтних парків, заказників, пам'яток природи і заповідних урочищ, розташованих у регіонах перебування ПЗУ.