Методи дослідження під час перевірок визначають механізм практичного виконання завдань і передбачають поєднання документальних, аналітичних, технічних, інструментальних, організаційних і експертних підходів. Метою є отримання відомостей державного контролю та встановлення їх відповідності вимогам законодавства.
Під час перевірки застосовуються такі методи дослідження:
документальне вивчення (накази, політики, журнали, звіти, плани, договори);
опитування та отримання пояснень (пояснення керівника суб’єкта державного контролю, керівника з кіберзахисту, адміністраторів, користувачів);
огляд і спостереження (огляд робочих місць, програмно-апаратних засобів захисту системи, інтерфейсів адміністрування, журналів подій);
аналітичне зіставлення отриманих даних (порівняння документально задекларованого стану з фактичним).