У цій Методиці, терміни вживаються у такому значенні:
біогенні елементи - хімічні елементи, необхідні для життєдіяльності водяних організмів, серед яких найбільшу небезпеку для забруднення та евтрофування водних об’єктів несуть сполуки нітрогену і фосфору;
біогеохімічна нестійкість - здатність речовин до трансформації за участі живих організмів з наступним залученням утворених продуктів у геохімічний колообіг;
вищі водяні рослини - рослини, які живуть у воді і поділяються на занурених нижньою частиною та повністю або більшою частиною занурених у воду;
дифузні джерела - розосереджені джерела надходження забруднюючих речовин до водного об’єкта шляхом їхнього вимивання з водозбірної площі;
евтрофні водойми - водні об’єкти з найвищим рівнем біологічної продуктивності екосистеми, що супроводжується порушенням балансу організмів окремих угрупувань, а також широким коливанням значення рН води і вмісту розчиненого кисню, виникненням придонної гіпоксії і зменшенням прозорості води;
зона - обмежена частина земної поверхні, що має однорідні характеристики щодо забруднення вод нітратними сполуками;
зони, вразливі до (накопичення) нітратів - ділянки суші, з яких відбувається стік у водні об’єкти, що потерпають від забруднення нітратними сполуками;
показники водяної флори - кількісний склад основних таксономічних одиниць (груп організмів, об’єднаних на основі загальноприйнятих методів класифікації та пов’язаних між собою тим чи іншим ступенем спорідненості) і співвідношення між ними, найважливіші пропорції, видова насиченістьь водяної флори, тощо;
притока - водотік, що впадає у інший водотік;
пункт спостереження - точка з постійними географічними координатами, де проводяться спостереження;
ранг - номер складової ряду спостережень, упорядкованого у зростаючому порядку;
складова ряду спостережень - значення концентрації досліджуваного інгредієнту, виміряна у пробі води, відібраної у певному пункті спостережень у конкретну дату;
сполуки нітрогену - речовини, що містять у своєму складі нітроген, за винятком нітрогену у газоподібному молекулярному стані;
тренд часового ряду - основна тенденція зміни часового ряду;
часові ряди гідрохімічних спостережень - сукупність даних за окремими показниками хімічного складу води у пункті спостережень за певний період часу;
фітопланктон - здатні до фотосинтезу рослинні організми, які населяють товщу води і виробляють первинну продукцію органічної речовини.
Інші терміни, що використовуються у цій Методиці, вживаються у значенні, наведеному у Водному кодексі України.