Етапи проведення функціонального аудиту:
1) підготовчий:
визначення відповідального структурного підрозділу за проведення функціонального аудиту;
визначення строків проведення функціонального аудиту;
інформування працівників органу виконавчої влади про мету, строки та етапи проведення функціонального аудиту.
2) практичний:
заповнення анкети функціонального аудиту відповідно до інструкції.
3) аналітичний:
первинне опрацювання отриманих результатів функціонального аудиту;
проведення уточнюючих інтерв’ю з керівниками самостійних структурних підрозділів;
підготовка звіту за результатами функціонального аудиту.