Заходи, засоби та методи, що вживаються для захисту статистичних даних в ІС ОДС, уключаючи й конфіденційні дані, поділяють на організаційні, технічні та організаційно-технічні, зокрема:
організаційні (процедурні) заходи з обліку та зберігання паперових та електронних носіїв інформації, що містять конфіденційні дані;
технічні (програмні, програмно-апаратні) засоби захисту, що реалізуються для контролю забезпечення статистичної конфіденційності під час обробки в ІС ОДС, і засоби захисту, що реалізуються комплексною системою захисту інформації;
організаційно-технічні заходи із фізичного захисту будівель і приміщень, контролю території (кодові замки, організація пропускного режиму, охоронна сигналізація, захист електронного комунікаційного обладнання та кабелів зв’язку тощо).