Протокол після його складання реєструється в журналі обліку протоколів про військові адміністративні правопорушення (далі - Журнал обліку протоколів) (додаток 4) військової частини (органу управління Служби правопорядку). Нумерація Протоколів проводиться в межах кожного календарного року окремо.
Журнал обліку протоколів має бути прошитий, прошнурований, пронумерований, підписаний посадовою особою та скріплений печаткою військової частини (органу управління Служби правопорядку).
Ведення Журналу обліку протоколів здійснює посадова особа, призначена наказом командира (начальника) військової частини (начальника органу управління Служби правопорядку).