Утилізація трупів птиці, відходів інкубації здійснюється у спеціально обладнаному цеху. При цьому необхідно забезпечити повне знезараження відходів інкубації.
За відсутності обладнаного цеху утилізації трупи птиці та відходи інкубації утилізують шляхом спалення.