Очищення неблагополучних свиногосподарств та/або окремих приміщень здійснюється з метою видалення з приміщень або з інших місць, де перебували свині, забруднених матеріалів, що можуть сприяти розповсюдженню захворювання, та їх знешкодження.
Очищення розпочинається відразу після вивезення свиней або їхніх туш для утилізації. Частини приміщень, у яких перебували свині, та всі інші частини приміщень, які були заражені, слід обробити засобами для дезінфекції у концентрації, достатній для знищення вірусу ВХС. Засіб дезінфекції має залишатися на обробленій поверхні щонайменше 24 години.
Усі рідкі розчини, підстилки, корми тваринного походження та інші предмети, що можуть бути контаміновані ВХС, слід видалити з приміщень, скласти та обробити засобом для дезінфекції. Гній слід обробити у спосіб, який гарантує знищення вірусу ВХС, засобом для дезінфекції, що має рівень pH більше ніж 12,5.
Усе пересувне обладнання має бути винесене з приміщень або інших місць, де утримувалися свині, очищене та дезінфіковане.
Жир та інший бруд слід видалити з усіх поверхонь шляхом розчинення знежирюючим агентом та змити водою під тиском.
Щільно зачинені приміщення, в яких перебували свині, слід обробити аерозольно.
Частини приміщень, у яких немає горючих матеріалів, можуть оброблятися високими температурами за допомогою відкритого вогню. Такі заходи здійснюються з дотриманням протипожежних заходів у присутності відповідних служб.
Усі поверхні слід обробити лужним засобом для дезінфекції, що має рівень pH більше ніж 12,5, або будь-яким іншим схваленим засобом для дезінфекції. Засіб для дезінфекції має бути змитим через 48 годин після нанесення.
Обробка вогнем або лужним засобом для дезінфекції має повторюватися через 14 днів.
Після закінчення операцій з очищення, дезінфекції та дезінсекції представник компетентного органу особисто пересвідчується, що заходи було виконано належним чином та минув належний період (не менший, ніж 28 днів), для гарантування того, що збудника захворювання повністю знищено.