Управління військовими перевезеннями водним транспортом включає:
безперервне збирання, вивчення та аналіз даних обстановки на морських та річкових шляхах сполучення;
організацію взаємодії органів військових сполучень з військовими частинами та власниками засобів водного транспорту;
контроль, облік, звіт та аналіз військових морських та річкових перевезень.