У разі відсутності комендатури військових сполучень безпосередньо в порту відправлення (призначення) зазначені функції виконує установа військових сполучень, у межах встановленої територіальної відповідальності за організацію військових перевезень водним транспортом якої знаходиться порт відправлення (призначення).
Порядок встановлення меж територіальної відповідальності, обов’язки та права посадових осіб установ військових сполучень визначаються ЦУВІСП.