ЦВКК є вищим водолазно-кваліфікаційним органом у НГУ.
На ЦВКК покладаються такі обов’язки:
приймання заліків з допуску до керівництва водолазними спусками та роботами у командирів частин (підрозділів), капітанів кораблів (суден), їх заступників (старших помічників) та інших посадових осіб, функціональними обов’язками яких передбачено керівництво водолазними спусками та роботами;
приймання заліків у ВКК органів військового управління оперативно-територіальних об'єднань НГУ, з'єднань, військових частин (підрозділів), навчальних військових частин (центрів), баз, установ;
приймання заліків у водолазних спеціалістів з допуску до керівництва та ведення водолазних спусків та робіт з метою підтвердження водолазних кваліфікацій;
приймання заліків у лікарського складу з допуску медичного забезпечення водолазних спусків та робіт;
керівництво діяльністю підпорядкованих ВКК;
розгляд скарг на висновки ВКК та прийняття рішень щодо них.