Робота спеціаліста поліграфа здійснюється з дотриманням вимог Конституції України, Конвенції про захист прав людини і основоположних свобод, Кодексу законів про працю України, Законів України «Про Державну прикордонну службу України», «Про державну службу», «Про запобігання корупції», «Про оперативно-розшукову діяльність», «Про інформацію», «Про захист персональних даних», «Про державну таємницю», Положення про проходження громадянами України військової служби в Державній прикордонній службі України, затвердженого Указом Президента України від 29 грудня 2009 року № 1115/2009, та інших нормативно-правових актів.