Фінансування НАДПСУ з питань діяльності ад’юнктури та докторантури здійснюється за рахунок коштів Державного бюджету України.
Оплата витрат, пов’язаних із розмножуванням автореферату дисертації військовослужбовців та працівників Держприкордонслужби, здійснюється за рахунок кошторису НАДПСУ за фактичними витратами.