Підготовка НПНК у Державній прикордонній службі України здійснюється за державним замовленням, науковими спеціальностями, перспективними та річними планами. Зазначені плани опрацьовуються з урахуванням потреб Державної прикордонної служби України в НПНК для комплектування посад, які підлягають заміщенню особами з науковим ступенем. Посади, які підлягають заміщенню особами з науковим ступенем, зазначені в Переліку посад у Національній академії Державної прикордонної служби України та Науково-дослідному інституті Державної прикордонної служби України, які підлягають заміщенню особами з науковим ступенем (додаток 2).