Ректор НАДПСУ безпосередньо організовує та забезпечує виконання планів підготовки НПНК, відповідає за якість підготовки кандидатів та докторів наук, за ефективне (за призначенням) використання в НАДПСУ осіб з науковим ступенем і вченим званням. Керівництво підготовкою НПНК здійснюється ректором НАДПСУ через учену раду академії та науково-дослідний відділ.