У Міноборони бухгалтерський облік операцій із передачі боєприпасів на утилізацію та здійснення реалізації отриманих продуктів їх утилізації ведеться Департаментом фінансів Міністерстві оборони України (далі - Департамент фінансів) за участі Головного управління.
Для відображення в бухгалтерському обліку Міноборони проведених господарських операцій Головним управлінням не пізніше наступного робочого дня після отримання відповідних первинних документів забезпечується внесення попередньої облікової інформації про здійснені господарські операції у спеціалізований програмний комплекс і в установленому порядку надають до Департаменту фінансів відповідні первинні документи в триденний строк, але не пізніше останнього дня звітного періоду, в який здійснювалася господарська операція.
Департаментом фінансів перевіряється відповідність внесеної попередньої облікової інформації та відображаються здійснені господарські операції за бухгалтерським обліком Міноборони. Перевірені та відображені в бухгалтерському обліку документи з відміткою «відображено в обліку» в установленому законодавством порядку повертаються Головному управлінню для врахування в аналітичному обліку та для зберігання.
Головне управління забезпечує господарські операції, правильність оформлення первинних документів, повноту і своєчасність внесення в спеціалізований програмний комплекс попередньої облікової інформації.
У Головному управлінні визначаються особи, які забезпечують документальне супроводження, внесення в спеціалізований програмний комплекс попередньої облікової інформації проведених операцій.