Протокол не пізніше наступного дня після його складання реєструється в Журналі обліку протоколів про військові адміністративні правопорушення (додаток 2). Журнал повинен бути прошитий, прошнурований, пронумерований, підписаний посадовою особою та скріплений печаткою військової частини.
Крім цього, у цьому журналі проставляється відмітка про вручення другого примірника протоколу.