Для оцінки рівня контамінації визначають питому вагу контамінованих пробірок від загального числа засіяних пробірок для кожного живильного середовища. Така оцінка проводиться щомісяця, а в разі неадекватного рівня контамінації чи незадовільних результатів контролю якості - щотижня. Розрахунок рівня контамінації проводять за такою формулою:
Допустимий рівень контамінації для посівів у рідкі живильні середовища становить 6,0-8,0 %.
Високий рівень контамінації може бути викликано такими причинами:
недостатній час деконтамінації;
низька концентрація NaOH, NALC;
розчин NALC-NaOH приготований більше ніж 24 год тому;
незадовільна якість реагентів;
проблеми з референс-штамом (нежиттєздатний, неправильна каламутність суспензії);
нестерильні розчини.
Низький рівень контамінації, відсутність росту або незначний ріст культур мікобактерій може бути спричинено такими факторами:
перевищення часу деконтамінації зразків більше ніж на 20 хв;
завищена концентрація NaOH, NALC;
незадовільна якість реагентів;
проблеми з референс-штамом (нежиттєздатний, неправильна каламутність суспензії);
не належний рівень рН (вище ніж 8);
не належний режим центрифугування (час, швидкість, температура).