Внутрішній контроль якості мікроскопічного дослідження проводиться під час фарбування кожної партії мазків.
Із цією метою досліджуються контрольні (свідомо позитивні та негативні мазки), які готують заздалегідь, фіксують і зберігають у закритому контейнері.
Для підготовки контрольних мазків бажано використовувати справжні проби мокротиння, проте допустимо додавати до проб мокротиння суспензію М. tuberculosis (для позитивних мазків), кишкової палички чи інших некислотостійких паличок (для негативних мазків).
З кожного зразка мокротиння готують принаймні по 20 мазків, максимально ідентичних за розміром і товщиною, маркуючи кожну серію мазків одним і тим самим ідентифікаційним номером.
Мазки забарвлюють, переглядають 2–3 мазки з кожної серії, зазначають середню кількість КСБ для КСБ+ мазків у журналі контролю якості.
Позитивні і негативні контрольні мазки включають до кожної партії мазків, що будуть забарвлюватися. Мікроскопію контрольних мазків слід проводити перед мікроскопією мазків від пацієнтів.
Досліджують контрольні мазки, зазначають результати в журналі контролю якості, реєструючи номер партії барвника та/або дату приготування розчину.
Незадовільними результатами контролю мікроскопічного дослідження за Цілем-Нільсеном є такі:
у позитивному контрольному мазку КСБ забарвлені не яскраво або їх кількість занадто мала;
фон позитивного контрольного мазка залишається червоним;
у негативному контрольному мазку виявляються КСБ;
у мазках наявні конгломерати барвника.
Незадовільними результатами контролю мікроскопічного дослідження із забарвленням флуорохромами є такі:
у позитивному контрольному мазку КСБ забарвлені в неяскравий жовтий колір або їх кількість занадто мала;
фон негативного контрольного мазка залишається яскраво-жовтим після знебарвлення;
фон занадто темний або містить надто багато флуоресціюючих артефактів;
у негативному контрольному мазку виявляються КСБ.
Якщо під час проведення контролю якості відзначаються проблеми принаймні в одному із вищезазначених пунктів, слід з’ясувати, чи мали місце проблеми з притуванням розчинів, і повторити забарвлення двох негативних і двох позитивних контрольних мазків, зважаючи на можливі помилки. Якщо в разі повторного фарбування мають місце незадовільні результати, слід приготувати нові розчини барвників.