В Інструкції визначена процедура приймання до суднових ізольованих баластних танків тільки чистого водяного баласту і скидання його на акваторіях річкових внутрішніх водних шляхів і річкових портів.
Усі інші суднові стічні води (підсланеві, господарсько-побутові, лляльні, промивні, баластні з неізольованих танків) під час плавання суден на річкових внутрішніх водних шляхах підлягають здаванню на судна-збирачі, очисні плавстанції або приймальні споруди портів.
У разі виявлення забруднювальних речовин або шкідливих водних організмів і патогенних мікроорганізмів ізольований баласт очищається і знезаражується на відповідних очисних установках порту.