З метою здійснення контролю за усуненням об’єктами перевірки виявлених під час перевірки порушень може проводитися контрольна перевірка. Контрольна перевірка проводиться за рішенням начальника ДОДТЛ чи начальника регіонального органу СБУ у разі, якщо:
від об’єкта перевірки не надійшло повідомлення про усунення недоліків;
за результатами перевірки комісією зроблено висновок про те, що стан ведення обліку, зберігання і використання документів та інших матеріальних носіїв інформації, що містять службову інформацію, не відповідає вимогам законодавства у сфері захисту інформації з обмеженим доступом.