Органи військової контррозвідки Служби безпеки України, крім Управління військової контррозвідки Служби безпеки України в Автономній Республіці Крим і місті Севастополі, здійснюють позапланові перевірки стану обігу документів у військових частинах і установах Збройних Сил України, Державної прикордонної служби України та інших військових формувань, які перебувають у сфері контррозвідувального забезпечення цих органів, на підставі отриманої в установленому законодавством порядку інформації щодо ознак передачі або збирання з метою передачі іноземним організаціям або їх представникам відомостей, які становлять конфіденційну інформацію, що є власністю держави, а також передумов до витоку такої інформації внаслідок порушень вимог законодавства у цій сфері.
Такі перевірки організовуються та здійснюються за участю співробітників підрозділів охорони державної таємниці регіональних органів Служби безпеки України.