Бюджетні асигнування на заходи боротьби з епідеміями можуть витрачатися на проведення спеціальних заходів, спрямованих на ліквідацію захворювань серед людей на чуму, холеру, натуральну віспу, туляремію, сибірку, бруцельоз, лептоспіроз, епідемічний висипний тиф, ВІЛ-інфекцію/СНІД, епідемічні енцефаліти, черевний тиф, дизентерію, сальмонельози, дифтерію, грип, вірусні гепатити, трихінельоз, інші інфекційні та паразитарні захворювання, а також випадків масових отруєнь людей і проведення епідеміологічних та епізоотичних обстежень, винищувальних і дератизаційних робіт на територіях, ензоотичних щодо чуми, туляремії, лептоспірозу та інших природно-вогнищевих інфекцій.
Указані асигнування можуть також витрачатись на проведення позапланових протиепідемічних заходів при збільшенні захворюваності або загрозі поширення інфекційних і паразитарних захворювань у розмірах, які не перевищують 25 відсотків від загальних сум асигнувань на боротьбу з епідеміями.