Контроль на підприємствах здійснюється шляхом перевірки бухгалтерських документів про нараховану заробітну плату та інші виплати, на які нараховуються страхові внески, платіжних доручень на перерахування сум страхових внесків та інших платежів на відповідний рахунок Фонду, касових документів про сплату часткової (повної) вартості путівок на лікування та відпочинок, виданих за рахунок коштів соціального страхування, видаткових документів на проведені виплати і перерахування, актів про нещасні випадки, пов'язані з виробництвом, відповідності фінансових звітів по коштах соціального страхування балансовим рахункам "Розрахунки по соціальному страхуванню".
Перевірці підлягають документи за поточний період року і за попередній календарний рік.
За більш ранні періоди перевірка документів проводиться при виявленні порушень встановленого порядку, зловживань у витрачанні коштів чи приховуванні сум виплат, на які належало нараховувати страхові внески.