Координацію діяльності з ВПП та цивільно-військову координацію на оперативному рівні здійснюють Украероцентр, центри ОрПР з відповідними органами управління видів ЗС України, правоохоронних органів, інших військових формувань, утворених відповідно до чинного законодавства, органами ОПР, відомчими органами УПР, координаційними центрами з пошуку та рятування, користувачами повітряного простору для вирішення оперативних питань під час планування та провадження діяльності з ВПП. Метою зазначеної координації є забезпечення безпеки та ефективності повітряного руху в разі одночасного виконання польотів цивільних та державних ПС, провадження іншої діяльності з ВПП та контролю за дотриманням порядку та правил ВПП України.
Цивільно-військова координація на оперативному рівні здійснюється на підставі інструкцій щодо взаємодії та має забезпечувати своєчасний оперативний обмін достовірною інформацією та координацію дій щодо ВПП.