У разі сплати єдиного податку в грошовій формі платники податку перераховують у визначені строки кошти на окремий рахунок відділень Державного казначейства України у районах запровадження експерименту.
Кошти за сільськогосподарську продукцію, поставлену в рахунок єдиного податку, заготівельні підприємства і організації перераховують на окремий рахунок відділення Державного казначейства України у районі запровадження експерименту не пізніше наступного дня за відвантаженням продукції, а переробні - не пізніше наступного дня після отримання продукції від платників. Реалізація сільськогосподарської продукції в рахунок єдиного податку провадиться за цінами, які склалися на товарних біржах або на споживчому ринку реалізації відповідної продукції.
Відділення Державного казначейства України у Глобинському районі Полтавської області, Старобешівському районі Донецької області та Ужгородському районі Закарпатської області наступного дня після надходження коштів розмежовують і перераховують суми єдиного податку до відповідних бюджетів та державних цільових фондів і повідомляють відповідний податковий орган про суми податку та їх розмежування.
Відділення Державного казначейства України у районах запровадження експерименту розмежовує кошти у такому порядку:
у Глобинському районі Полтавської області:
60 відсотків зараховується до Державного бюджету України і державних цільових фондів у співвідношенні:
до Державного бюджету України - 4 відсотки;
на обов'язкове державне пенсійне страхування - 40 відсотків;
до Фонду для здійснення заходів щодо ліквідації наслідків Чорнобильської катастрофи та соціального захисту населення - 11 відсотків;
на обов'язкове соціальне страхування - 2 відсотки;
на будівництво, реконструкцію, ремонт і утримання автомобільних доріг загального користування України - 3 відсотки;
40 відсотків зараховується до місцевого бюджету;
у Старобешівському районі Донецької області:
75 відсотків зараховується до Державного бюджету України і державних цільових фондів у співвідношенні:
до Державного бюджету України - 3 відсотки;
на обов'язкове державне пенсійне страхування - 44 відсотки;
до Фонду для здійснення заходів щодо ліквідації наслідків Чорнобильської катастрофи та соціального захисту населення - 15 відсотків;
на обов'язкове соціальне страхування - 6 відсотків;
на будівництво, реконструкцію, ремонт і утримання автомобільних доріг загального користування України - 7 відсотків;
25 відсотків зараховується до місцевого бюджету;
в Ужгородському районі Закарпатської області:
80 відсотків зараховується до Державного бюджету України і державних цільових фондів у співвідношенні:
до Державного бюджету України - 3 відсотки;
на обов'язкове державне пенсійне страхування - 48 відсотків;
до Фонду для здійснення заходів щодо ліквідації наслідків Чорнобильської катастрофи та соціального захисту населення - 20 відсотків;
на обов'язкове соціальне страхування - 6 відсотків;
на будівництво, реконструкцію, ремонт і утримання автомобільних доріг загального користування України - 3 відсотки;
20 відсотків зараховується до місцевого бюджету.
На час експерименту зберігається порядок відносин (дотації), які склалися у 1997 році між обласним і районним бюджетами.