Фінансування та матеріально-технічне забезпечення органів і установ державної ветеринарної медицини, сплата внесків до Міжнародного епізоотичного бюро та інших міжнародних організацій здійснюються за рахунок коштів Державного бюджету України і місцевих бюджетів, а також за рахунок позабюджетних коштів.
Позабюджетними джерелами фінансування органів і установ державної ветеринарної медицини та оплати праці їх працівників є:
надходження від підприємств, установ, організацій та громадян за виконання робіт за договорами і за надання платних послуг;
сорок відсотків суми адміністративних штрафів, які накладаються державними інспекторами ветеринарної медицини, спрямовуються на розвиток матеріальної бази системи державної ветеринарної медицини;
добровільні внески підприємств, установ, організацій і громадян;
інші джерела, не заборонені законодавством.