Основними завданнями Комісії є:
аналіз можливих наслідків вступу України до СОТ та обґрунтування стратегії розвитку економіки України після вступу до СОТ;
підготовка узгоджених пропозицій з питань переговорного процесу щодо вступу України до СОТ;
підготовка рекомендацій щодо узгоджених дій законодавчої і виконавчої влади у формуванні стабільного і прозорого правового поля для реалізації внутрішньої та зовнішньої політики з урахуванням вимог СОТ та активного сприяння національній економіці, включаючи створення умов і процедур для забезпечення кваліфікованої участі України у системі вирішення суперечок в рамках СОТ;
аналіз міжнародних договорів щодо їх відповідності вимогам СОТ та вироблення рекомендацій стосовно подальшого застосування договорів, які не відповідатимуть таким вимогам;
напрацювання рекомендацій щодо адаптації законодавства до вимог СОТ, а також законодавчого забезпечення зменшення негативних наслідків вступу до СОТ і сталого розвитку економіки України на шляху до вступу і після вступу до СОТ, включаючи нормативно-правові акти органів державної влади та органів місцевого самоврядування;
напрацювання рекомендацій щодо реформування системи державного управління виходячи з вимог СОТ та з метою забезпечення сталого розвитку національної економіки в нових умовах функціонування після вступу України до СОТ;
контроль і координація діяльності щодо підготовки проектів законодавчих актів та підзаконних нормативно-правових актів, які виконуються з метою адаптації законодавства України до вимог СОТ, а також законодавчого забезпечення зменшення негативних наслідків вступу до СОТ та сталого розвитку економіки України на шляху до вступу і після вступу до СОТ;
підготовка рекомендацій з організації співпраці між органами державної влади, суб'єктами господарювання та громадськими організаціями у створенні ефективної системи інформаційного забезпечення щодо вимог і стандартів СОТ та умов їх застосування, а також спільних дій з метою підвищення обізнаності громадськості з питань умов і наслідків приєднання України до СОТ;
підготовка рекомендацій щодо комплексних заходів стосовно пом'якшення соціальних наслідків входження України до СОТ.