Діяльність центру фінансується за рахунок коштів Державного бюджету України та коштів, отриманих від користувачів його послуг.
У межах виділених бюджетних коштів фінансуються:
науково-дослідні роботи;
надсилання повідомлень до міжнародних та регіональних організацій;
утримання та забезпечення функціонування центру.
Кошти, отримані від користувачів центру, спрямовуються виключно на розвиток його науково-технічної бази.