Основними функціями СЗІ під час впровадження комплексної системи захисту інформації є:
- визначення переліку відомостей, які підлягають захисту в процесі обробки, інших об'єктів захисту в ІТС, класифікації інформації за вимогами до її конфіденційності або важливості для Офісу Генерального прокурора, необхідних рівнів захищеності інформації, визначення порядку введення (виведення) та використання інформації в ІТС;
- розроблення та коригування моделі загроз і моделі порушника, політики безпеки інформації в ІТС;
- визначення і формування вимог до КСЗІ;
- організація і координація, спільно з відповідним підрозділом Офісу Генерального прокурора, робіт з проєктування та розроблення КСЗІ, безпосередня участь у проєктних роботах зі створення КСЗІ;
- підготовка технічних пропозицій, рекомендацій щодо запобігання витоку інформації технічними каналами та попередження спроб несанкціонованого доступу до інформації під час створення КСЗІ;
- організація робіт і участь у випробуваннях КСЗІ, у проведенні її експертизи;
- вибір організацій-виконавців робіт зі створення КСЗІ, здійснення контролю за дотриманням встановленого порядку проведення робіт із захисту інформації, погодження основних технічних і розпорядчих документів, що супроводжують процес створення КСЗІ (технічне завдання, техноробочий проєкт, програма і методика випробувань, плани робіт тощо);
- участь у розробленні проєктів організаційно-розпорядчих документів, які встановлюють правила доступу користувачів до ресурсів ІТС, визначають порядок, норми, правила захисту інформації та здійснення контролю за їх дотриманням (інструкцій, положень, наказів, рекомендацій тощо), відповідальність за порушення вимог щодо безпеки інформації та встановлених правил експлуатації КСЗІ.